- 產(chǎn)品介紹
XM-Q800R3聚能式超聲DNA剪切儀是小美超聲公司是國內(nèi)較早為CHIP實(shí)驗(yàn)（染色質(zhì)免疫共沉淀—一種研究蛋白與DNA相互作用的技術(shù)）而設(shè)計的，整套設(shè)備由一體式主機(jī)、聚能式換能器、杯式探頭、樣品支架、可透視消音箱和冷卻水循環(huán)機(jī)等幾個部分組成。經(jīng)二代測序儀Illumina廠家實(shí)驗(yàn)室測試使用，設(shè)備的性能和實(shí)驗(yàn)結(jié)果非常好，媲美進(jìn)口產(chǎn)品。
全基因組測序（Whole Genome Sequencing, WGS）是基因組較為多的研究方案。WGS通過對人類細(xì)胞中的基因組（包括線粒體）所有的30億堿基進(jìn)行測序，測定其DNA的堿基序列，從而可在全基因組水平上檢測與人類疾病相關(guān)的單核苷酸變異(SNVs)、插入缺失(In Dels)、拷貝數(shù)變異(CNVs)和結(jié)構(gòu)變異(SVs)等多種突變信息，進(jìn)而得到完整的人體“說明書”。XM-Q800R3打斷儀為全基因提供高效、均一、穩(wěn)定的樣品前處理。
- 應(yīng)用公司介紹
希望組(Grandomics）是三代測序大數(shù)據(jù)技術(shù)和應(yīng)用的開拓者，成立于2011年8月8日，曾用“未來組”品牌開拓三代測序科技服務(wù)，是三代測序服務(wù)公司和三代測序大數(shù)據(jù)診斷公司。
多年來，一直專注于在三代測序平臺上進(jìn)行技術(shù)開發(fā)與應(yīng)用拓展，目前，已經(jīng)形成了“科技服務(wù)”、“醫(yī)學(xué)診斷”、“生物信息”、“先進(jìn)制造”四大業(yè)務(wù)模塊；在北京、武漢建設(shè)了合計超過5,000平米的科研服務(wù)平臺、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室；引進(jìn)了國際先進(jìn)的ONT PromethION 48、PacBio Sequel II、MGISEQ2000/T7、Bionano Saphyr光學(xué)圖譜等技術(shù)平臺。
非接觸式DNA打斷是全基因組測序的前處理步驟，打斷效果是否均一、穩(wěn)定，這關(guān)系著是否影響后續(xù)全基因組序列的準(zhǔn)確性。測試階段客戶使用參數(shù)為：4℃循環(huán)水。百分100功率，運(yùn)行10s，停止10s，15分鐘打斷效果如下圖：agilent 2100測試結(jié)果表明時間過長，均一性不好。
經(jīng)過調(diào)整后，效果提升。
根據(jù)片段大小，可以調(diào)整不同的實(shí)驗(yàn)時間和功率。
- 應(yīng)用展望
全基因組測序基本上在所有三代測序這個都有大范圍的應(yīng)用，我司非接觸式DNA打斷儀有多種通量和效率可以選擇，XM-Q800R3是目前效率較高，但是通量較小的一款設(shè)備，通過與未來組的合作應(yīng)用，我們將加速研發(fā)改進(jìn)設(shè)備的應(yīng)用，使其更加匹配到全基因組測序的服務(wù)中。
